A második szakaszban készül el - az állapotfelmérési dokumentációra, valamint releváns nemzetközi példákra támaszkodó - stratégiai terv, amely tartalmazza a rövid, közép és hosszú távú célokat és irányokat, a területen az egyes problémagócok esetében alkalmazandó javasolt beavatkozásokat, beleértve a kármentesítési feladatokat, valamint azok ütemezését, illetve a finanszírozás módját, beleértve a támogatási lehetőségeket is.